MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-4 DNA

Total Repeats: 482

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020822	GT	3	6	49	54	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020822	GCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020822	AAG	2	6	256	261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020822	T	6	6	281	286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020822	ACG	2	6	340	345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279654
6	NC_020822	ACT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279654
7	NC_020822	ATG	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279654
8	NC_020822	A	6	6	657	662	100 %	0 %	0 %	0 %	472279654
9	NC_020822	ACGAA	2	10	704	713	60 %	0 %	20 %	20 %	472279654
10	NC_020822	A	7	7	767	773	100 %	0 %	0 %	0 %	472279654
11	NC_020822	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	472279654
12	NC_020822	GATCA	2	10	824	833	40 %	20 %	20 %	20 %	472279655
13	NC_020822	TCAAG	2	10	841	850	40 %	20 %	20 %	20 %	472279655
14	NC_020822	ATG	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
15	NC_020822	CGGT	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	472279655
16	NC_020822	CGG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279655
17	NC_020822	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279655
18	NC_020822	TCC	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279655
19	NC_020822	CCAAG	2	10	1216	1225	40 %	0 %	20 %	40 %	472279655
20	NC_020822	CGA	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
21	NC_020822	TAA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
22	NC_020822	TGA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279655
23	NC_020822	CAT	2	6	1417	1422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
24	NC_020822	TAC	2	6	1457	1462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
25	NC_020822	A	6	6	1466	1471	100 %	0 %	0 %	0 %	472279655
26	NC_020822	ATTC	2	8	1486	1493	25 %	50 %	0 %	25 %	472279655
27	NC_020822	T	6	6	1544	1549	0 %	100 %	0 %	0 %	472279655
28	NC_020822	TCA	2	6	1658	1663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279655
29	NC_020822	AGC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279655
30	NC_020822	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279655
31	NC_020822	T	6	6	1771	1776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020822	ATGT	2	8	1794	1801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020822	CAG	2	6	1829	1834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020822	ATT	2	6	1887	1892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020822	CTT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020822	TAT	2	6	1962	1967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020822	CAA	2	6	1981	1986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020822	GTA	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020822	ACAAA	2	10	2028	2037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020822	TG	3	6	2052	2057	0 %	50 %	50 %	0 %	472279656
41	NC_020822	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
42	NC_020822	TTTA	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
43	NC_020822	GAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279656
44	NC_020822	A	7	7	2326	2332	100 %	0 %	0 %	0 %	472279656
45	NC_020822	TGAT	2	8	2409	2416	25 %	50 %	25 %	0 %	472279656
46	NC_020822	ATT	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279656
47	NC_020822	AAT	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
48	NC_020822	TGA	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
49	NC_020822	GAT	2	6	2504	2509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
50	NC_020822	A	6	6	2513	2518	100 %	0 %	0 %	0 %	472279656
51	NC_020822	ATA	2	6	2538	2543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
52	NC_020822	TCA	2	6	2565	2570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279656
53	NC_020822	CTC	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279656
54	NC_020822	AT	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	472279656
55	NC_020822	TCTA	2	8	2640	2647	25 %	50 %	0 %	25 %	472279656
56	NC_020822	ATTT	2	8	2657	2664	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
57	NC_020822	GAT	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279656
58	NC_020822	TATT	2	8	2727	2734	25 %	75 %	0 %	0 %	472279656
59	NC_020822	TAA	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279656
60	NC_020822	AT	3	6	2805	2810	50 %	50 %	0 %	0 %	472279656
61	NC_020822	T	6	6	2906	2911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020822	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
63	NC_020822	A	6	6	3107	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	472279657
64	NC_020822	AAC	2	6	3175	3180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
65	NC_020822	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279657
66	NC_020822	CAA	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279657
67	NC_020822	CAG	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
68	NC_020822	GAT	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279657
69	NC_020822	GAC	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279657
70	NC_020822	C	7	7	3564	3570	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_020822	TTTC	2	8	3607	3614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020822	AGC	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279658
73	NC_020822	CT	3	6	3808	3813	0 %	50 %	0 %	50 %	472279658
74	NC_020822	ATGG	2	8	3861	3868	25 %	25 %	50 %	0 %	472279658
75	NC_020822	ATC	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279658
76	NC_020822	CTCG	2	8	4044	4051	0 %	25 %	25 %	50 %	472279658
77	NC_020822	T	6	6	4177	4182	0 %	100 %	0 %	0 %	472279658
78	NC_020822	GCG	2	6	4219	4224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279658
79	NC_020822	GAA	2	6	4405	4410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279658
80	NC_020822	GCC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279658
81	NC_020822	AATC	2	8	4521	4528	50 %	25 %	0 %	25 %	472279658
82	NC_020822	GGT	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279658
83	NC_020822	GTT	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279658
84	NC_020822	TAA	3	9	4736	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020822	ACT	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279659
86	NC_020822	TAAG	2	8	4793	4800	50 %	25 %	25 %	0 %	472279659
87	NC_020822	GAGC	2	8	4841	4848	25 %	0 %	50 %	25 %	472279659
88	NC_020822	TTC	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279659
89	NC_020822	GAA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279659
90	NC_020822	TCAA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	0 %	25 %	472279659
91	NC_020822	GCT	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279659
92	NC_020822	ATA	2	6	5044	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279659
93	NC_020822	TTGA	2	8	5051	5058	25 %	50 %	25 %	0 %	472279659
94	NC_020822	ACC	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279659
95	NC_020822	T	8	8	5230	5237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020822	TCAA	2	8	5307	5314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020822	CAT	2	6	5648	5653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020822	ATA	2	6	5714	5719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020822	C	6	6	5726	5731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_020822	TGA	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020822	GTA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020822	TAA	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020822	ATA	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020822	CAA	2	6	5864	5869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020822	T	6	6	5913	5918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020822	TAA	2	6	5922	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020822	A	6	6	5926	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020822	T	6	6	5957	5962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020822	TCAAG	2	10	5999	6008	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020822	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020822	GTA	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
112	NC_020822	GA	3	6	6160	6165	50 %	0 %	50 %	0 %	472279660
113	NC_020822	GAA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
114	NC_020822	CAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279660
115	NC_020822	GTC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279660
116	NC_020822	GAT	2	6	6400	6405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279660
117	NC_020822	TCA	2	6	6449	6454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279660
118	NC_020822	TCT	2	6	6552	6557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
119	NC_020822	GCG	2	6	6595	6600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279660
120	NC_020822	CTT	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279660
121	NC_020822	TGT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279660
122	NC_020822	AGC	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279660
123	NC_020822	CG	3	6	6735	6740	0 %	0 %	50 %	50 %	472279660
124	NC_020822	GAA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279660
125	NC_020822	TCGAG	2	10	6882	6891	20 %	20 %	40 %	20 %	472279660
126	NC_020822	CAG	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020822	TAGC	2	8	7087	7094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020822	GTC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020822	T	6	6	7177	7182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020822	CA	3	6	7218	7223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020822	CCAC	2	8	7233	7240	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_020822	TGA	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020822	T	6	6	7261	7266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020822	TAAGT	2	10	7270	7279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020822	ATTG	2	8	7286	7293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020822	TGTA	2	8	7348	7355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020822	ATA	2	6	7384	7389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020822	T	6	6	7396	7401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020822	GTC	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020822	ATT	2	6	7473	7478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279661
141	NC_020822	A	7	7	7564	7570	100 %	0 %	0 %	0 %	472279661
142	NC_020822	T	6	6	7572	7577	0 %	100 %	0 %	0 %	472279661
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275	NC_020822	CTG	2	6	14699	14704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279671
276	NC_020822	TAC	2	6	14721	14726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279671
277	NC_020822	CGA	2	6	14727	14732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279671
278	NC_020822	TTG	2	6	14741	14746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279671
279	NC_020822	GTG	2	6	14786	14791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279671
280	NC_020822	ATC	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279671
281	NC_020822	TA	3	6	14858	14863	50 %	50 %	0 %	0 %	472279671
282	NC_020822	ATT	2	6	14876	14881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279671
283	NC_020822	TGG	2	6	14979	14984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279671
284	NC_020822	ACT	2	6	15155	15160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279671
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291	NC_020822	CAA	2	6	15394	15399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279671
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293	NC_020822	TAAAT	2	10	15417	15426	60 %	40 %	0 %	0 %	472279671
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297	NC_020822	GAG	2	6	15725	15730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_020822	ATT	2	6	15810	15815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_020822	CCTCA	2	10	15831	15840	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
300	NC_020822	TAT	2	6	15885	15890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_020822	T	6	6	16001	16006	0 %	100 %	0 %	0 %	472279672
302	NC_020822	TGA	2	6	16035	16040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279672
303	NC_020822	TAG	2	6	16067	16072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279672
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305	NC_020822	GTT	2	6	16236	16241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279672
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402	NC_020822	CTC	2	6	20614	20619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279674
403	NC_020822	CGT	2	6	20620	20625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
404	NC_020822	T	6	6	20650	20655	0 %	100 %	0 %	0 %	472279674
405	NC_020822	CAA	2	6	20763	20768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
406	NC_020822	AGA	2	6	20769	20774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279674
407	NC_020822	T	7	7	20838	20844	0 %	100 %	0 %	0 %	472279674
408	NC_020822	TTG	2	6	20896	20901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279674
409	NC_020822	ATC	2	6	20950	20955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
410	NC_020822	GCA	2	6	20960	20965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279674
411	NC_020822	CCG	2	6	21004	21009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279674
412	NC_020822	AAG	2	6	21017	21022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279674
413	NC_020822	CAAA	2	8	21107	21114	75 %	0 %	0 %	25 %	472279674
414	NC_020822	T	7	7	21484	21490	0 %	100 %	0 %	0 %	472279674
415	NC_020822	ATTA	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	472279674
416	NC_020822	ACC	2	6	21619	21624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279674
417	NC_020822	AAC	2	6	21644	21649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
418	NC_020822	CAT	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279674
419	NC_020822	CGG	2	6	21714	21719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472279674
420	NC_020822	GCT	2	6	21731	21736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279674
421	NC_020822	GTTATT	2	12	21820	21831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	472279674
422	NC_020822	ATTG	2	8	21900	21907	25 %	50 %	25 %	0 %	472279674
423	NC_020822	AAC	2	6	21928	21933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279674
424	NC_020822	TTCC	2	8	21968	21975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
425	NC_020822	TAT	2	6	22001	22006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_020822	A	6	6	22082	22087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_020822	A	7	7	22168	22174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_020822	CTTG	2	8	22189	22196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
429	NC_020822	CAA	2	6	22242	22247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_020822	A	6	6	22313	22318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_020822	TAA	2	6	22333	22338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_020822	T	6	6	22376	22381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_020822	AAT	2	6	22396	22401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_020822	AGG	2	6	22461	22466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_020822	AGA	2	6	22503	22508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279675
436	NC_020822	CAA	3	9	22527	22535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279675
437	NC_020822	TGA	2	6	22735	22740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
438	NC_020822	AATG	2	8	22809	22816	50 %	25 %	25 %	0 %	472279675
439	NC_020822	T	6	6	22835	22840	0 %	100 %	0 %	0 %	472279675
440	NC_020822	TAC	2	6	22864	22869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279675
441	NC_020822	AGAGA	2	10	22883	22892	60 %	0 %	40 %	0 %	472279675
442	NC_020822	TGC	2	6	22937	22942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279675
443	NC_020822	GCA	2	6	22955	22960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279675
444	NC_020822	TGA	2	6	22979	22984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
445	NC_020822	TTG	2	6	23053	23058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279675
446	NC_020822	TC	3	6	23095	23100	0 %	50 %	0 %	50 %	472279675
447	NC_020822	ATG	2	6	23118	23123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279675
448	NC_020822	TGG	2	6	23196	23201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279675
449	NC_020822	A	7	7	23212	23218	100 %	0 %	0 %	0 %	472279675
450	NC_020822	TTA	2	6	23259	23264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020822	GGT	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279676
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481	NC_020822	TCA	3	9	25317	25325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279678
482	NC_020822	A	6	6	25325	25330	100 %	0 %	0 %	0 %	472279678